Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc4Q8BP86 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc4Q8BP86 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms