Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgo2Q7TSY8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sgo2Q7TSY8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms