Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot1Q6ZQ08 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot1Q6ZQ08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms