Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ecm29Q6PDI5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm29Q6PDI5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms