Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ScapQ6GQT6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ScapQ6GQT6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms