Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp9cQ66X01 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp9cQ66X01 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp9cQ66X01 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms