Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc9a2Q3ZAS0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a2Q3ZAS0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms