Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930567H17RikQ3V0K5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms