Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SfswapQ3USH5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SfswapQ3USH5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms