Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl4Q3URY0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms