Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx6-3Q3UHX8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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