Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr41Q3UDP0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr41Q3UDP0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms