Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms