Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim63Q38HM4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim63Q38HM4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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