Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ptchd1Q14B62 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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