Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pate4Q09098 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pate4Q09098 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms