Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MitfQ08874 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms