Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r236Q05A06 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms