Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou2f2Q00196 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms