Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox5P52651 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox5P52651 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms