Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmod1P49813 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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