Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms