Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpraP18052 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpraP18052 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpraP18052 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtpraP18052 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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