Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spi1P17433 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spi1P17433 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spi1P17433 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms