Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RhoP15409 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RhoP15409 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RhoP15409 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RhoP15409 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RhoP15409 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms