Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NclP09405 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NclP09405 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NclP09405 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NclP09405 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NclP09405 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NclP09405 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NclP09405 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NclP09405 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NclP09405 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NclP09405 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NclP09405 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NclP09405 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NclP09405 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NclP09405 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NclP09405 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NclP09405 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NclP09405 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NclP09405 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NclP09405 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NclP09405 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NclP09405 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NclP09405 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NclP09405 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NclP09405 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NclP09405 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NclP09405 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NclP09405 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NclP09405 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NclP09405 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NclP09405 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NclP09405 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NclP09405 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NclP09405 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NclP09405 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NclP09405 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NclP09405 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NclP09405 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NclP09405 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NclP09405 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NclP09405 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NclP09405 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NclP09405 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NclP09405 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NclP09405 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NclP09405 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NclP09405 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NclP09405 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NclP09405 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NclP09405 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NclP09405 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NclP09405 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NclP09405 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NclP09405 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NclP09405 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NclP09405 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NclP09405 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NclP09405 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NclP09405 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NclP09405 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NclP09405 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NclP09405 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NclP09405 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NclP09405 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NclP09405 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NclP09405 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NclP09405 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NclP09405 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NclP09405 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NclP09405 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NclP09405 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NclP09405 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NclP09405 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NclP09405 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms