Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1baO35930 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gp1baO35930 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1baO35930 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms