Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf5O35445 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf5O35445 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms