Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms