Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1iE9Q7P2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms