Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700019A02RikA0A087WPV9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms