Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Knop1Q9Z2Q2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Knop1Q9Z2Q2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms