Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod3Q9R0E1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod3Q9R0E1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms