Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm4Q9QXA5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm4Q9QXA5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms