Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmgn5Q9JL35 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgn5Q9JL35 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms