Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ69

Kcnip2, Kv channel-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip2Q9JJ69 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip2Q9JJ69 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip2Q9JJ69 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip2Q9JJ69 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip2Q9JJ69 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip2Q9JJ69 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip2Q9JJ69 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms