Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smco4Q9JIS3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smco4Q9JIS3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms