Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl28Q9JIL2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms