Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Cldn19Q9ET38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Cldn19Q9ET38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Cldn19Q9ET38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Cldn19Q9ET38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Cldn19Q9ET38 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Cldn19Q9ET38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Cldn19Q9ET38 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn19Q9ET38 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn19Q9ET38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms