Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OtofQ9ESF1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms