Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms