Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrpraQ9DBG7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrpraQ9DBG7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrpraQ9DBG7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms