Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med29Q9DB91 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med29Q9DB91 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms