Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfn4Q9D6I3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfn4Q9D6I3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfn4Q9D6I3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfn4Q9D6I3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pfn4Q9D6I3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfn4Q9D6I3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms