Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D1K7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1K7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms