Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tspan11Q9D1D1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms