Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znhit3Q9CQK1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms