Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid1ip1Q9CQ20 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms