Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim3Q99PE5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim3Q99PE5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms