Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf1Q91VU1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms